RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DPF2	Q92785	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A0G2JLW4	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CBX4	O00257	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PSMD14	O00487	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LAG3	P18627	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CD38	P28907	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ACTN2	P35609	894 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CDK17	Q00537	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TAP1	Q03518	808 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	STIM1	Q13586	685 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNB1	Q14721	858 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PIGB	Q92521	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PHKB	Q93100	1093 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	WDR24	Q96S15	920 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GLI3	P10071	1580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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