RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 HOXC13P31276 330 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3CAP42336 1068 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 DPYDQ12882 1025 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ZACNQ401N2 412 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ACOT1Q86TX2 421 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 NUP93Q8N1F7 819 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 108.1
PPP4C-211ENST00000567642 USP18Q9UMW8 372 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 LEFTY2O00292 366 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 HRO43593 1189 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RNF40O75150 1001 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF202O95125 648 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 TCF3P15923 654 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 NR2F2P24468 414 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 YWHAQP27348 245 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 VAMP7P51809 220 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SV2AQ7L0J3 742 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FAM35AQ86V20 835 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CD101Q93033 1021 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO32Q969P5 355 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 KCNK16Q96T55 309 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RNF38Q9H0F5 515 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CPQQ9Y646 472 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 EML5Q05BV3 1969 aa22.26■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 IKBKBO14920 756 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 NFATC1O95644 943 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 HLA-DRAP01903 254 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CNR2P34972 360 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ZXDBP98169 803 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ORC1Q13415 861 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CEP68Q76N32 757 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 TAF4BQ92750 862 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.25■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 AP1G2O75843 785 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 KRT13P13646 458 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 NDST1P52848 882 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SLC7A9P82251 487 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FOXK2Q01167 660 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 MAPK13O15264 365 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 AKAP3O75969 853 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM49P0CI25 452 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM49CP0CI26 452 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC130P13994 396 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SPEM2Q0P670 501 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO43Q4G163 708 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 KRT82Q9NSB4 513 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA6P31267 233 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 GCLMP48507 274 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SLC5A3P53794 718 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM9Q13443 819 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 NFIL3Q16649 462 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FUKQ8N0W3 1084 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 OLFM2O95897 454 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 RETP07949 1114 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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