RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566210.1

BBS2-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-213	ENST00000566210	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210		Q6ZWC4	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS2-213	ENST00000566210	AOX1	Q06278	1338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	QSOX1	O00391	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	IL18RAP	O95256	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PRKCG	P05129	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	FES	P07332	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PDHA1	P08559	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	IL1R2	P27930	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PTH2R	P49190	550 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PROK1	P58294	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	DAG1	Q14118	895 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	REPS1	Q96D71	796 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PSMD9	O00233	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	AREL1	O15033	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	RASSF9	O75901	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	MT-ND5	P03915	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ADORA2A	P29274	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	UQCRC1	P31930	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	GK	P32189	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CYP2C18	P33260	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CLCN2	P51788	898 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	TIRAP	P58753	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SP2	Q02086	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SNX22	Q96L94	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210		A8MVJ9	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	A1BG	P04217	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CD19	P15391	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	TPH1	P17752	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CTGF	P29279	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CASP5	P51878	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-213	ENST00000566210	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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