RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SOCS7	O14512	581 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CHAD	O15335	359 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MT-ND3	P03897	115 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	JADE1	Q6IE81	842 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TWNK	Q96RR1	684 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SAR1A	Q9NR31	198 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		19.23	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GPR25	O00155	361 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PRPSAP2	O60256	369 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB7A	O95365	584 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ADRA1D	P25100	572 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CDH6	P55285	790 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM192	Q8IY95	271 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP69	A5D8W1	941 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GJB1	P08034	283 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN3	P51790	818 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PDK2	Q15119	407 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	STIL	Q15468	1287 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC125	Q86Z20	511 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HPDL	Q96IR7	371 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PAK5	Q9P286	719 aa		19.22	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IRF6	O14896	467 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	INHBA	P08476	426 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ELK3	P41970	407 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	INCA1	Q0VD86	236 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ORC1	Q13415	861 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ11	Q14654	390 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD2	Q14681	263 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TAF5	Q15542	800 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BOLA3	Q53S33	107 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf38	Q8TB03	319 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MGAM	O43451	1857 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LPXN	O60711	386 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFRA	P16234	1089 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DES	P17661	470 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PTK7	Q13308	1070 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ACCSL	Q4AC99	568 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CHSY1	Q86X52	802 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF276	Q8N554	614 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HAO1	Q9UJM8	370 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559		A8MUI8	341 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	C22orf31	O95567	290 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PGK2	P07205	417 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	KRT81	Q14533	505 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ILDR2	Q71H61	639 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	GPC2	Q8N158	579 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		19.2	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FAF2	Q96CS3	445 aa		19.2	■□□□□ 0.66

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