RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRT40Q6A162 431 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 COG5Q9UP83 839 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLIM4O00461 696 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR42O15529 346 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC26A4O43511 780 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KATNA1O75449 491 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 LY86O95711 162 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCL23P55773 120 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAP1Q03518 808 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGA7Q13683 1181 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNK18Q7Z418 384 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHST13Q8NET6 341 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABGGTAQ92696 567 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNRHR2Q96P88 292 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 NYAP2Q9P242 653 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO40Q9UH90 709 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 F5H6K3 240 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC14BO60729 498 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTHFD2P13995 350 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 BPIFB4P59827 614 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNTN2Q02246 1040 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLRC3Q07444 240 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAGE13Q4V321 117 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTR9Q6PD62 1173 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 UIMC1Q96RL1 719 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPP7Q9UHL4 492 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PR48 441 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIR2DL3P43628 341 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAM8P78325 824 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNFAIP2Q03169 654 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITKQ08881 620 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGAT5Q09328 741 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP8Q13202 625 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 MORC4Q8TE76 937 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNKSO95271 1327 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOX4O94842 621 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANAPC15P60006 121 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSMC6P62333 389 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLP2Q04941 152 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACAP1Q15027 740 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE3CQ15386 1083 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUM1Q2TAK8 710 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 SBK1Q52WX2 424 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOR2AQ5JU69 321 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE4AQ5TA78 99 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPXCR1Q8N123 301 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTMR8Q96EF0 704 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPHA2Q96T91 129 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACAD9Q9H845 621 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms