RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 EBF3Q9H4W6 596 aa8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 INVSQ9Y283 1065 aa8.6□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SFI1A8K8P3 1242 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 XBP1P17861 261 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CDC25AP30304 524 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 EPHB3P54753 998 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MESP2Q0VG99 397 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ACAP1Q15027 740 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 APPL2Q8NEU8 664 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 E2F7Q96AV8 911 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 FAM84AQ96KN4 292 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 IFT74Q96LB3 600 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 VPS45Q9NRW7 570 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 GKN1Q9NS71 199 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 OBP2AQ9NY56 170 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 APC2O95996 2303 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TISP43B9A030 160 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 AKAP3O75969 853 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 NFICP08651 508 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 CREB5Q02930 508 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 RING1Q06587 406 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 MCL1Q07820 350 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 GAB4Q2WGN9 574 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 PMS2CLQ68D20 193 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 DEFB124Q8NES8 71 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 GIPC2Q8TF65 315 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 NUDT8Q8WV74 236 aa8.58□□□□□ -1.04
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RD3L-201ENST00000557640 SLC22A12Q96S37 553 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 GPR88Q9GZN0 384 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TASP1Q9H6P5 420 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 KLK13Q9UKR3 277 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 MAFFQ9ULX9 164 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TBX20Q9UMR3 447 aa8.58□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 OR6C75A6NL08 312 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 LACTBL1A8MY62 500 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TAF4O00268 1085 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 HCRTO43612 131 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TOM1L1O75674 476 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 CAVIN2O95810 425 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 CAPNS1P04632 268 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TYMPP19971 482 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 WEE1P30291 646 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 GJA4P35212 333 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 NLRP12P59046 1061 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 RUNX3Q13761 415 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 MYBPC2Q14324 1141 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 DMC1Q14565 340 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TTC38Q5R3I4 469 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 TXNDC8Q6A555 127 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.57□□□□□ -1.04
RD3L-201ENST00000557640 FRMD1Q8N878 549 aa8.57□□□□□ -1.04
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