RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 RASSF9O75901 435 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF39-210ENST00000556718 GRPP07492 148 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF39-210ENST00000556718 CELA2AP08217 269 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF39-210ENST00000556718 SLC11A2P49281 568 aa5.07□□□□□ -1.6
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PRPF39-210ENST00000556718 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 VWA1Q6PCB0 445 aa5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.07□□□□□ -1.6
PRPF39-210ENST00000556718 PDPRQ8NCN5 879 aa5.07□□□□□ -1.6
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