RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	STK17A	Q9UEE5	414 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	L1RE1	Q9UN81	338 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	C2orf78	A6NCI8	922 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LEFTY2	O00292	366 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRIM66	O15016	1216 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	AP5Z1	O43299	807 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PPP1R37	O75864	691 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KAT7	O95251	611 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADH1C	P00326	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	APOD	P05090	189 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ITGB3	P05106	788 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FAM163B	P0C2L3	166 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GAP43	P17677	238 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ENG	P17813	658 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SPINK2	P20155	84 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	BCKDHB	P21953	392 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GART	P22102	1010 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CMA1	P23946	247 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ANXA13	P27216	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GRIK1	P39086	918 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SEC13	P55735	322 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SEMA3B	Q13214	749 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC14A1	Q13336	389 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ALCAM	Q13740	583 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DHCR24	Q15392	516 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SURF1	Q15526	300 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PIP4P1	Q86T03	277 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ALLC	Q8N6M5	410 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	IQUB	Q8NA54	791 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OTUB2	Q96DC9	234 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PAGE5	Q96GU1	130 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ACCS	Q96QU6	501 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	STRA6	Q9BX79	667 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CDH9	Q9ULB4	789 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HPSE	Q9Y251	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQ27	194 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQ64	194 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQD8	194 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TISP43	B9A030	160 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OPHN1	O60890	802 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF217	O75362	1048 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF202	O95125	648 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GCNT3	O95395	438 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OLFM2	O95897	454 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CYP17A1	P05093	508 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SYP	P08247	313 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SERPINF2	P08697	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KRT19	P08727	400 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TIE1	P35590	1138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PTGER3	P43115	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAPK8	P45983	427 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CASP5	P51878	434 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RING1	Q06587	406 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PNOC	Q13519	176 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GAB4	Q2WGN9	574 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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