RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 BFSP1Q12934 665 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 ISM2Q6H9L7 571 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 USP37Q86T82 979 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 PTPRDP23468 1912 aa14.8□□□□□ -0.04
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CS-231ENST00000552222 MAP3K13O43283 966 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TADA3O75528 432 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 AVPR1AP37288 418 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 PRCPP42785 496 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 NLRP12P59046 1061 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 LMAN2Q12907 356 aa14.79□□□□□ -0.04
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CS-231ENST00000552222 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SYT12Q8IV01 421 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 ALLCQ8N6M5 410 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TDP1Q9NUW8 608 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 ASB3Q9Y575 518 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 OR6C75A6NL08 312 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SGK1O00141 431 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 PDXKO00764 312 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CLTAP09496 248 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 WEE1P30291 646 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CDC25CP30307 473 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 OPRD1P41143 372 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 P2RY2P41231 377 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SLC6A11P48066 632 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 MTF1Q14872 753 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CRY1Q16526 586 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 KYAT1Q16773 422 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CCDC142Q17RM4 750 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 EML3Q32P44 896 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 ACDQ96AP0 544 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-231ENST00000552222 TNFRSF10BO14763 440 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 TIE1P35590 1138 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 ZXDBP98169 803 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 FBXO43Q4G163 708 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 ITIH5Q86UX2 942 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 HMGB4Q8WW32 186 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 SENP8Q96LD8 212 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 GCNAQ96QF7 691 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 CITO14578 2027 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 LACTBL1A8MY62 500 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 CLIC2O15247 247 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 OPHN1O60890 802 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-231ENST00000552222 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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