RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ADCY6O43306 1168 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 ARIH2O95376 493 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 RBP3P10745 1247 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 HERVK_113P62684 666 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 SKP1P63208 163 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 ACKR2O00590 384 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 PGM1P36871 562 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 SZRD1Q7Z422 152 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.8□□□□□ -1
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