RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 CYP2F1P24903 491 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 GPR17Q13304 367 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 EFHC1Q5JVL4 640 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 VSTM1Q6UX27 236 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 FBXO22Q8NEZ5 403 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 PBKQ96KB5 322 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CAPZA3Q96KX2 299 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 MTRRQ9UBK8 725 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM59LQ9UK28 342 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 C2CD2LO14523 706 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 GRAP2O75791 330 aa29.09■■■□□ 2.25
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GNPTAB-206ENST00000549940 GLUD2P49448 558 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC26A9Q7LBE3 791 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 NIPA2Q8N8Q9 360 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 PGLYRP2Q96PD5 576 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CDY1Q9Y6F8 540 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 F8VP50 259 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF185O15231 689 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 PDGFRAP16234 1089 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 GPD1P21695 349 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 OGDHQ02218 1023 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 RAB41Q5JT25 222 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC181Q5TID7 509 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 SCN4BQ8IWT1 228 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP112Q8N8E3 955 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 MNS1Q8NEH6 495 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CLEC4CQ8WTT0 213 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 COG1Q8WTW3 980 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CD101Q93033 1021 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CNGB3Q9NQW8 809 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-206ENST00000549940 CES2O00748 559 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 SART1O43290 800 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 SLU7O95391 586 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 URODP06132 367 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CTNNA2P26232 953 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 RABGGTBP53611 331 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 DSG1Q02413 1049 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 SPPL2BQ8TCT7 592 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 RXFP2Q8WXD0 754 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ASNSD1Q9NWL6 643 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 RNF14Q9UBS8 474 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 C2CD4BA6NLJ0 364 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 HHLA1C9JL84 531 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM66O15016 1216 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 MAGEA11P43364 429 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 NDUFV1P49821 464 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ACAP1Q15027 740 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 TAF5Q15542 800 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ARCQ7LC44 396 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CPNE8Q86YQ8 564 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM149B1Q96BN6 582 aa29.06■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 ULBP1Q9BZM6 244 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 RNF8O76064 485 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 FGF18O76093 207 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 PAFAH1B1P43034 410 aa29.05■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 RHOT1Q8IXI2 618 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 VPS52Q8N1B4 723 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 ATAD1Q8NBU5 361 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CNPY3Q9BT09 278 aa29.05■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 FLT3P36888 993 aa29.05■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 KRT35Q92764 455 aa29.05■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 MTMR11A4FU01 709 aa29.04■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 GLI1P08151 1106 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 OR1D2P34982 312 aa29.04■■■□□ 2.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CREG2Q8IUH2 290 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.249e-8■■■■□ 24.8
GNPTAB-206ENST00000549940 C8orf48Q96LL4 319 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 PTPRDP23468 1912 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP104O60308 925 aa29.03■■■□□ 2.24
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