RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548338.5

CNOT2-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-211ENST00000548338 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 SSH3Q8TE77 659 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 FAM136AQ96C01 138 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 GCC1Q96CN9 775 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 GPR20Q99678 358 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.1□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DKK3Q9UBP4 350 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 VPS51Q9UID3 782 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.1□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 MARCH11A6NNE9 402 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 VWC2LB2RUY7 222 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 KIF28PB7ZC32 967 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DIRC3C9JPN6 131 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 MUSKO15146 869 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 PPP6R2O75170 966 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 TAF5LO75529 589 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 KRT38O76015 456 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 CDKL5O76039 1030 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 INMTO95050 263 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 FESP07332 822 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 C1SP09871 688 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 SRGNP10124 158 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 IDEP14735 1019 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 ACRV1P26436 265 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 LIPAP38571 399 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 VAV2P52735 878 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 BCAT1P54687 386 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 WDR78Q5VTH9 848 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 MAVSQ7Z434 540 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 ZNF276Q8N554 614 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 CEP72Q9P209 647 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 FEM1BQ9UK73 627 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.09□□□□□ -1.91
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CNOT2-211ENST00000548338 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.09□□□□□ -1.91
CNOT2-211ENST00000548338 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.09□□□□□ -1.91
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