RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0B4J269	797 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRX2	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DCLK1	O15075	740 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS4B	O75351	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CHEK2	O96017	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGB1	P05556	798 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	POLB	P06746	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EGR1	P18146	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MAK	P20794	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTF	P26441	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DDIT3	P35638	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT3	P56703	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	HHEX	Q03014	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF12	Q16514	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DOK3	Q7L591	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP72	Q9P209	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM155B	O75949	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GYS1	P13807	737 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	VIPR2	P41587	438 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CPT1A	P50416	773 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FSTL1	Q12841	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDH17	O14917	1159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP27B1	O15528	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CCP110	O43303	1012 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FCER1A	P12319	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NPPB	P16860	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ATIC	P31939	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MED25	Q71SY5	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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