RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 CSH2P0DML3 217 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 IGFBP4P22692 258 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 YWHAQP27348 245 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 PLCB3Q01970 1234 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 GPR17Q13304 367 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TCTN1Q2MV58 587 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 WDR59Q6PJI9 974 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 TFAP2BQ92481 460 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 CWH43Q9H720 699 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 COX16Q9P0S2 106 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-210ENST00000544244 LINC01553A4QN01 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 F8VP50 259 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ITGB1P05556 798 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CTSAP10619 480 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PDGFRAP16234 1089 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CTNNA2P26232 953 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DUSP4Q13115 394 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PIGZQ86VD9 579 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PCED1BQ96HM7 432 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TWNKQ96RR1 684 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 IGFLR1Q9H665 355 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MTRRQ9UBK8 725 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 LZTS1Q9Y250 596 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DAPK3O43293 454 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PRPSAP2O60256 369 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CYP2F1P24903 491 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NOMO3P69849 1222 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DSG1Q02413 1049 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PDCLQ13371 301 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NUP93Q8N1F7 819 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ABCB6Q9NP58 842 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CYLDQ9NQC7 956 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HCSTQ9UBK5 93 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MAFFQ9ULX9 164 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GABRDO14764 452 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NEBLO76041 1014 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MOCS3O95396 460 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZBED1O96006 694 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF132P52740 706 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ADIGQ0VDE8 80 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KRT81Q14533 505 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RTP2Q5QGT7 225 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HGSNATQ68CP4 663 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FERMT1Q9BQL6 677 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 THAP2Q9H0W7 228 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM51Q9NW97 253 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MARCH5Q9NX47 278 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HSF2BPO75031 334 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO45P0C2W1 286 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GPD1P21695 349 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RRM1P23921 792 aa5.95□□□□□ -1.46
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