RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PJA1Q8NG27 643 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THAP9Q9H5L6 903 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HEBP1Q9NRV9 189 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2orf78A6NCI8 922 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BEST1O76090 585 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CKMP06732 381 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADORA2BP29275 332 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TUBP50607 506 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GCNT1Q02742 428 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF10Q12962 218 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF394Q53GI3 561 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1958Q8N8K9 716 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXO32Q969P5 355 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCL26Q9Y258 94 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAN2B1O00754 1011 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP3K7CLP57077 242 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF77Q15935 545 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC22A12Q96S37 553 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NELL2Q99435 816 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DUSP16Q9BY84 665 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIT1Q9Y3P8 196 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHISA7A6NL88 538 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HHLA1C9JL84 531 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK25O00506 426 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PI15O43692 258 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAEPP09466 180 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HDCP19113 662 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAGEA9P43362 315 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC7A9P82251 487 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRMPQ12912 555 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRSS33Q8NF86 280 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACO1P21399 889 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPN5P54829 565 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTF1Q14872 753 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAN2A1Q16706 1144 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMYD5Q6GMV2 418 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIN3Q8TB24 985 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM81BQ96LP2 452 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP2S1Q96SQ9 504 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FOXQ1Q9C009 403 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCML2Q9UQR0 700 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUC6Q6W4X9 2439 aa17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCAM2O15394 837 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VDRP11473 427 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCAT1P54687 386 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC8A3P57103 927 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBXN2BQ14CS0 331 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDGFRLQ15198 375 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SGO2Q562F6 1265 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM270Q6UE05 265 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms