RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HSFY1Q96LI6 401 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 DESI2Q9BSY9 194 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CYLDQ9NQC7 956 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 IL37Q9NZH6 218 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HESX1Q9UBX0 185 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 YIPF1Q9Y548 306 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 USP3Q9Y6I4 520 aa8.26□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 E5RJQ4 531 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 RTN2O75298 545 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 RRM1P23921 792 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGAP25P42331 645 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 MAP3K7CLP57077 242 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TCEAL1Q15170 157 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 DDR2Q16832 855 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 C2CD6Q53TS8 623 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 VPS36Q86VN1 386 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SCML4Q8N228 414 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 FAM122AQ96E09 287 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SPATA17Q96L03 361 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 MED10Q9BTT4 135 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 THAP2Q9H0W7 228 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 KCND1Q9NSA2 647 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 INTUQ9ULD6 942 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TFR2Q9UP52 801 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.25□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 FAM170AA1A519 330 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM66O15016 1216 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PJA2O43164 708 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GPR37L1O60883 481 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CSPG5O95196 566 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GLP2RO95838 553 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GLUD1P00367 558 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 ABL1P00519 1130 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CYP1A2P05177 515 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 POU2F2P09086 479 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM253P0C7T8 217 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 EPCAMP16422 314 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 KLRC2P26717 231 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HOXA9P31269 272 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SCNN1AP37088 669 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 RGS7P49802 495 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TKTL1P51854 596 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 VAV2P52735 878 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SLC5A3P53794 718 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GALCP54803 685 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 USP46P62068 366 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 HYAL1Q12794 435 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TRNP1Q6NT89 227 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 XYLT1Q86Y38 959 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 GJD3Q8N144 294 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 STKLD1Q8NE28 680 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.24□□□□□ -1.09
C16orf62-211ENST00000540101 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms