RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 BDNFP23560 247 aa22.48■■□□□ 1.19
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CITED2-202ENST00000536159 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.45■■□□□ 1.19
CITED2-202ENST00000536159 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.45■■□□□ 1.19
CITED2-202ENST00000536159 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.45■■□□□ 1.19
CITED2-202ENST00000536159 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.19
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CITED2-202ENST00000536159 ACAP1Q15027 740 aa22.43■■□□□ 1.18
CITED2-202ENST00000536159 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.43■■□□□ 1.18
CITED2-202ENST00000536159 RTP2Q5QGT7 225 aa22.43■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.43■■□□□ 1.18
CITED2-202ENST00000536159 ZNF558Q96NG5 402 aa22.43■■□□□ 1.18
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