RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-222ENST00000531967 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 DNM1LO00429 736 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 FANCGO15287 622 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 SLITRK3O94933 977 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 C22orf31O95567 290 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CYP1A2P05177 515 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CTSBP07858 339 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 PRR35P0CG20 571 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CTAGE8P0CG41 777 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 FAM157BP0CG42 384 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 ALADP13716 330 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 CPT2P23786 658 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 FLT3LGP49771 235 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 ADRM1Q16186 407 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 AGR3Q8TD06 166 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 SAMD11Q96NU1 681 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 ABCG8Q9H221 673 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 USP40Q9NVE5 1235 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 HSD17B2P37059 387 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 SETD6Q8TBK2 473 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-222ENST00000531967 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 DAPP1Q9UN19 280 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 ASB3Q9Y575 518 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-222ENST00000531967 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.54□□□□□ -1.52
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