RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.97■■□□□ 1.43
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZBED1O96006 694 aa23.9■■□□□ 1.42
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC175P0C221 793 aa23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-208ENST00000524325 ACADSBP45954 432 aa23.9■■□□□ 1.42
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