RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517246.1

RNA5SP415-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 415, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP415, Length 115 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP415-201ENST00000517246 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.28■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 CHFRQ96EP1 664 aa18.28■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 RNF38Q9H0F5 515 aa18.28■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa18.28■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 CETN3O15182 167 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 AP1G2O75843 785 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SMC2O95347 1197 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 TCF3P15923 654 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 PFKLP17858 780 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 YWHAQP27348 245 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 CXCL12P48061 93 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 PPP3CCP48454 512 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 IFNAR2P48551 515 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 PDE6CP51160 858 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCINQ13939 588 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 UNC93AQ86WB7 457 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 C12orf29Q8N999 325 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SPATA20Q8TB22 786 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SMARCE1Q969G3 411 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 FBXO32Q969P5 355 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 TIGD1Q96MW7 591 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 ECT2Q9H8V3 914 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 KRT82Q9NSB4 513 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.27■□□□□ 0.52
RNA5SP415-201ENST00000517246 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.27■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 LEFTY2O00292 366 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TNFRSF10BO14763 440 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 LILRB5O75023 590 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 GTF2H1P32780 548 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC7A9P82251 487 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 EML3Q32P44 896 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CPA6Q8N4T0 437 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SEMA4DQ92854 862 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TWNKQ96RR1 684 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SMOQ99835 787 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF292O60281 2723 aa18.26■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 BEST1O76090 585 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 GJA4P35212 333 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 GALK1P51570 392 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLC5A3P53794 718 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 INCA1Q0VD86 236 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 PPP2R5DQ14738 602 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 KRT39Q6A163 491 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ATP2A3Q93084 1043 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 IL37Q9NZH6 218 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CPQQ9Y646 472 aa18.25■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 OLFM2O95897 454 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CD58P19256 250 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ADORA2BP29275 332 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 NRLP54845 237 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 MAP3K7CLP57077 242 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 AMPD2Q01433 879 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 ISM2Q6H9L7 571 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 DCLK2Q8N568 766 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 WHAMMQ8TF30 809 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TSG101Q99816 390 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.24■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 K7ESF4 209 aa18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 EGFP01133 1207 aa18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 HOXC13P31276 330 aa18.23■□□□□ 0.51
RNA5SP415-201ENST00000517246 MXI1P50539 228 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms