RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 DCLK2Q8N568 766 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 RNF38Q9H0F5 515 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ECT2Q9H8V3 914 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 KRT82Q9NSB4 513 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF292O60281 2723 aa20.55■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 LEFTY2O00292 366 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 AP1G2O75843 785 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 YWHAQP27348 245 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 GJA4P35212 333 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 PPP3CCP48454 512 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 NRLP54845 237 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 EML3Q32P44 896 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FUKQ8N0W3 1084 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 RUBCNQ92622 972 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ATP2A3Q93084 1043 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FBXO32Q969P5 355 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 RMND1Q9NWS8 449 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.54■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TCF3P15923 654 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 PFKLP17858 780 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 HOXC13P31276 330 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 PRCPP42785 496 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SLC5A3P53794 718 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 AMPD2Q01433 879 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 DMWDQ09019 674 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 C12orf29Q8N999 325 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 EPC1Q9H2F5 836 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 CPQQ9Y646 472 aa20.53■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 BEST1O76090 585 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 OLFM2O95897 454 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 EGFP01133 1207 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 CD58P19256 250 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 FNTBP49356 437 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 GALK1P51570 392 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SLC7A9P82251 487 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 UNC93AQ86WB7 457 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 TWNKQ96RR1 684 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 SMOQ99835 787 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 NCDNQ9UBB6 729 aa20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTBP1-211ENST00000511907 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.52■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 K7ESF4 209 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 TNFRSF10BO14763 440 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 ADORA2BP29275 332 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 MAP3K7CLP57077 242 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 ENPEPQ07075 957 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 KRT39Q6A163 491 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 SMARCE1Q969G3 411 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 GSDMAQ96QA5 445 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.51■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 CETN3O15182 167 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 RNF40O75150 1001 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 SMC2O95347 1197 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 NFATC1O95644 943 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 MXI1P50539 228 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 INCA1Q0VD86 236 aa20.5■□□□□ 0.87
CTBP1-211ENST00000511907 LPAL2Q16609 132 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms