RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PIGBQ92521 554 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 WDR26Q9H7D7 661 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.91□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MAP2K2P36507 400 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 NPTX2P47972 431 aa5.9□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 ITPK1Q13572 414 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.9□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.9□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 MEGF6O75095 1541 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00473A8K010 186 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 H0YIN7 160 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 TOR1BO14657 336 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP10-11P60412 298 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 C3orf20Q8ND61 904 aa5.89□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 KMT5AQ9NQR1 393 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 HACL1Q9UJ83 578 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0B4J269 797 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 CHEK2O96017 543 aa5.88□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 DPF1Q92782 380 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.88□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF7Q9UBF6 113 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 POLHQ9Y253 713 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 C4AP0C0L4 1744 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 SLC16A6O15403 523 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 ARIH2O95376 493 aa5.87□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 HOXC9P31274 260 aa5.87□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF785A8K8V0 405 aa5.86□□□□□ -1.47
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PDE4D-217ENST00000509355 RARBP10826 455 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 GPD1P21695 349 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 PIK3CGP48736 1102 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 NDUFV1P49821 464 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 NOGQ13253 232 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM240Q5SV17 173 aa5.86□□□□□ -1.47
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