RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506928.5

POLK-208, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 5

Gene POLK, Length 3,820 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-208	ENST00000506928		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928		H0YCG3	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928		J3QW42	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ACKR2	O00590	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PEX11A	O75192	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RNF8	O76064	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SLITRK3	O94933	977 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GLI1	P08151	1106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PRG2	P13727	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ADAM17	P78536	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GRIK5	Q16478	980 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PEX13	Q92968	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	EYA3	Q99504	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MAN1A2	O60476	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RAG1	P15918	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TUBG1	P23258	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	HTD2	P86397	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ADAM15	Q13444	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LPIN1	Q14693	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MOG	Q16653	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CIB1	Q99828	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RAD51B	O15315	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LSP1	P33241	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PTGIR	P43119	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GTF2I	P78347	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GRB10	Q13322	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SNCB	Q16143	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	COL4A1	P02462	1669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928		A0A1B0GUA9	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PSMD9	O00233	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	EXOC3	O60645	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CLPTM1	O96005	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ALB	P02768	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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