RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK31Q9BXU1 1019 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM5Q9C035 493 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WIPF3A6NGB9 483 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TARM1B6A8C7 271 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F8W8V4 182 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H7C4K7 107 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCAT1P54687 386 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFF2Q03403 129 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INSCQ1MX18 579 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D5Q92609 795 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHKBQ93100 1093 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PADI4Q9UM07 663 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QSOX1O00391 747 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASSF9O75901 435 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENGP17813 658 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTGFP29279 349 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNIQ14094 377 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF7Q14155 803 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP1B1Q16678 543 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCID2Q5JVF3 399 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP85Q6P2H3 762 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNC13DQ70J99 1090 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPARTQ8N0X7 666 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPF1Q92782 380 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DKK4Q9UBT3 224 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MID2Q9UJV3 735 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC5A1P13866 664 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACVR2AP27037 513 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UQCRC1P31930 480 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIK3CBP42338 1070 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP4F2P78329 520 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC29A2Q14542 456 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SARGQ9BW04 601 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF3BO15066 747 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRGAP2O75044 1071 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JTBO76095 146 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASAL1O95294 804 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT-ND5P03915 603 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKCBP05771 671 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPTEP56180 551 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FANCBQ8NB91 859 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HASPINQ8TF76 798 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX22Q96L94 193 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF778Q96MU6 729 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR25Q96S07 402 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB27BO00194 218 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPSP0C0P6 89 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKAR1BP31321 381 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPT1AP50416 773 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGA8P53708 1063 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIRAPP58753 221 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E2F1Q01094 437 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms