RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 DPP3Q9NY33 737 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 GCNT4Q9P109 453 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 DEC1Q9P2X7 70 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C2CD2Q9Y426 696 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PTPRDP23468 1912 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TSC2P49815 1807 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 FAM149AA5PLN7 773 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 K7ENM7 598 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HUS1O60921 280 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CBFA2T3O75081 653 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CILPO75339 1184 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CTDNEP1O95476 244 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 NEFLP07196 543 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 NDUFV2P19404 249 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SCP2P22307 547 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PCSK1P29120 753 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 NTSR1P30989 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HNF1BP35680 557 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 WASP42768 502 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 GAD2Q05329 585 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PDIA5Q14554 519 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 GAB4Q2WGN9 574 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 INAVAQ3KP66 663 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TTC38Q5R3I4 469 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C12orf40Q86WS4 652 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CHPFQ8IZ52 775 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZNF843Q8N446 348 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ARID3AQ99856 593 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ACBD6Q9BR61 282 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 KCND2Q9NZV8 630 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.59□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 CPQQ9Y646 472 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 OBSL1O75147 1896 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.59□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 A0A0A0MRY4 1105 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 A0A0B4J269 797 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP6O43182 974 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TNFSF14O43557 240 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 FAM13AO94988 1023 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ADRB2P07550 413 aa6.58□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 MAOBP27338 520 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CD6P30203 668 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CDC25AP30304 524 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ABCD1P33897 745 aa6.58□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 PPP3CCP48454 512 aa6.58□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 SLC7A9P82251 487 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GUCY1B3Q02153 619 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SEMG2Q02383 582 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CFHR1Q03591 330 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MESP2Q0VG99 397 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 STARD3Q14849 445 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ANO4Q32M45 955 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ADALQ6DHV7 355 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NAT16Q8N8M0 369 aa6.58□□□□□ -1.36
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