RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF180	Q86T96	592 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP4	Q96MN2	994 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACCS	Q96QU6	501 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRCA2	P51587	3418 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR81	Q562E7	1941 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0B4J269	797 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMA7	O14818	248 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGEA5	O60502	916 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPAN1	O60635	241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CABYR	O75952	493 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NR3C1	P04150	777 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKCB	P05771	671 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB8	P26012	769 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBX1	P40424	430 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ6	P48051	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEPHS1	P49903	392 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLG4	P78352	724 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	APBA1	Q02410	837 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU5F1B	Q06416	359 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX17	Q15036	470 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTGIS	Q16647	500 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFIL3	Q16649	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM187B	Q17R55	369 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	XP32	Q5T750	250 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SARM1	Q6SZW1	724 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPAIN	Q86UA6	219 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC103	Q8IW40	242 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLCN	Q8NFG4	579 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCP11	Q8WWU5	503 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAAL1	Q96ER3	474 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPB2	Q96IY4	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMX1	Q9H3N1	280 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPC25	Q9HBM1	224 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARID2	Q68CP9	1835 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRJ	Q12913	1337 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7ERI5	159 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACKR2	O00590	384 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPHB6	O15197	1021 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASAP2	O43150	1006 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZEB2	O60315	1214 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAVIN2	O95810	425 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFSF9	P41273	254 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK7	P49862	253 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2J2	P51589	502 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF75D	P51815	510 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABRE	P78334	506 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34

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