RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ASPAP45381 313 aa29.57■■■□□ 2.32
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC7A9P82251 487 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 SPOPLQ6IQ16 392 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 IL37Q9NZH6 218 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 EHD2Q9NZN4 543 aa29.57■■■□□ 2.32
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HOXB3-211ENST00000490677 TRIM49CP0CI26 452 aa29.54■■■□□ 2.32
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HOXB3-211ENST00000490677 PGFP49763 221 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 SLC5A3P53794 718 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
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HOXB3-211ENST00000490677 ENGASEQ8NFI3 743 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 CD101Q93033 1021 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 MED10Q9BTT4 135 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.312e-8■■■■■ 246.4
HOXB3-211ENST00000490677 SMPD4Q9NXE4 827 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 AP1G2O75843 785 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 CNR2P34972 360 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 ADAM9Q13443 819 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-211ENST00000490677 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29.49■■■□□ 2.31
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