RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TRIM38	O00635	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	COQ9	O75208	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SRGN	P10124	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	AR	P10275	920 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	IDE	P14735	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TYRP1	P17643	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MST1	P26927	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	UQCRC1	P31930	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CCNI	Q14094	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CCT6B	Q92526	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LENG9	Q96B70	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ASNA1	O43681	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CREB3	O43889	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PEX11B	O96011	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PTGS2	P35354	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CLCN2	P51788	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PGD	P52209	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	BCAT1	P54687	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LNX2	Q8N448	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GLG1	Q92896	1179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454		Q96MF0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454		A1L4Q6	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ACKR2	O00590	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	YY2	O15391	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	USP1	O94782	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CHRM2	P08172	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GRK6	P43250	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GATM	P50440	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ITIH3	Q06033	890 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GPS1	Q13098	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FHL3	Q13643	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TBCC	Q15814	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SYT5	O00445	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FES	P07332	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SERPINF1	P36955	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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