RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481915.5

DYNC1LI1-208, Transcript of dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1, human

TSL 2

Gene DYNC1LI1, Length 4,791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915		E7EVH7	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CAPN9	O14815	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TMCC1	O94876	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MME	P08473	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ACR	P10323	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	UBASH3A	P57075	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	COG7	P83436	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	FPGS	Q05932	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MAPK7	Q13164	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MEA1	Q16626	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MSH4	O15457	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MFAP3L	O75121	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	S1PR4	O95977	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CLTA	P09496	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ALAS1	P13196	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	GBP1	P32455	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SPAG1	Q07617	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PLS1	Q14651	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	UBE2S	Q16763	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CEP68	Q76N32	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MIS12	Q9H081	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915		B4DLN1	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ENC1	O14682	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	DNAJC6	O75061	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PPP6R2	O75170	966 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TBX10	O75333	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	LCA5L	O95447	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CASP14	P31944	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	APBA1	Q02410	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MPP3	Q13368	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI1-208	ENST00000481915	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms