RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FAM212AQ96EL1 285 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF670Q9BS34 389 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 A8MXQ7 604 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KCNK3O14649 394 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TP73O15350 636 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 LILRB3O75022 631 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 VNN2O95498 520 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CALCAP01258 141 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 USP8P40818 1118 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MATKP42679 507 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF33AQ06730 810 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 WSCD1Q658N2 575 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DPF3Q92784 378 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TOP1MTQ969P6 601 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DEFB118Q96PH6 123 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DCLK3Q9C098 648 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 E5RJQ4 531 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SMAPO00193 183 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ITGAVP06756 1048 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CTSHP09668 335 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KLRC2P26717 231 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CYP2C18P33260 490 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MARCKSL1P49006 195 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DAOAP59103 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 XRCC4Q13426 336 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 C5orf22Q49AR2 442 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 BOLA3Q53S33 107 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MFSD5Q6N075 450 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 LPPQ93052 612 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KLK14Q9P0G3 267 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 WHRNQ9P202 907 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NEU3Q9UQ49 428 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HTTP42858 3142 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SOBPA7XYQ1 873 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TRAPPC3O43617 180 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FYNP06241 537 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TGM2P21980 687 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 IVDP26440 423 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CLCN6P51797 869 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 EFHC2Q5JST6 749 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ACOT1Q86TX2 421 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 METTL23Q86XA0 190 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MCEEQ96PE7 176 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM7Q9C029 511 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MTRRQ9UBK8 725 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SCML2Q9UQR0 700 aa6.77□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 WASH4PA8MWX3 477 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 H7C4K7 107 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM66O15016 1216 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PFKLP17858 780 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KDELR1P24390 212 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 IL4RP24394 825 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NOS2P35228 1153 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FAM193AP78312 1265 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CREMQ03060 361 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM60Q495X7 471 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RNF43Q68DV7 783 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TTC13Q8NBP0 860 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 PCED1BQ96HM7 432 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 SH3GL2Q99962 352 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HIPK3Q9H422 1215 aa6.76□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms