RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470565.5

UBE2V1-213, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 3

Gene UBE2V1, Length 728 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-213	ENST00000470565	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MYO1F	O00160	1098 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	LEFTY2	O00292	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	GOLIM4	O00461	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	AHSG	P02765	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CHN2	P52757	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ARFIP2	P53365	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CREM	Q03060	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CHRND	Q07001	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KIF22	Q14807	665 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CDSN	Q15517	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MNT	Q99583	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PSMD14	O00487	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CIAO1	O76071	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	GNAI2	P04899	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ALAS1	P13196	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	GCSH	P23434	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SELENOP	P49908	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CACNB3	P54284	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CXCL9	Q07325	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	MAST3	O60307	1309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565		E9PLN8	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565		K7ESM1	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	EYA2	O00167	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2V1-213	ENST00000470565	BCAR3	O75815	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms