RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SARG	Q9BW04	601 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	CHST8	Q9H2A9	424 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	KIF3B	O15066	747 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	RASAL1	O95294	804 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	MYL3	P08590	195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	NPS	P0C0P6	89 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	TPTE	P56180	551 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	TFF2	Q03403	129 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SPART	Q8N0X7	666 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	PHKB	Q93100	1093 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	REPS1	Q96D71	796 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM6-215	ENST00000466247	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	KPNA5	O15131	536 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	RGS10	O43665	173 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	SLC5A1	P13866	664 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	LMO1	P25800	156 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ABCG1	P45844	678 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	GRM1	Q13255	1194 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247		Q6ZWC4	215 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	SNX22	Q96L94	193 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	TBCB	Q99426	244 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PMM2	O15305	246 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	TJP3	O95049	919 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	MT-ND5	P03915	603 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM27	P14373	513 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ACVR2A	P27037	513 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	STK3	Q13188	491 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	INSC	Q1MX18	579 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	DDB2	Q92466	427 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	GABRQ	Q9UN88	632 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	POM121B	A6NF01	834 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PIAS2	O75928	621 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PRKCB	P05771	671 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CELA2A	P08217	269 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	HGF	P14210	728 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CTGF	P29279	349 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PRIM2	P49643	509 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CYP4F2	P78329	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	DAG1	Q14118	895 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	KCNAB1	Q14722	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	NPY5R	Q15761	445 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM6-215	ENST00000466247	FCRL6	Q6DN72	434 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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