RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCL26Q9Y258 94 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM170BA6NMN3 283 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD72P21854 359 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNH2Q12809 1159 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRSS33Q8NF86 280 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMOQ99835 787 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPRDP23468 1912 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM3CQ92520 227 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NACA2Q9H009 215 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GKN1Q9NS71 199 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARNTLO00327 626 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNFRSF10BO14763 440 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD23BP54727 409 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTC8Q8TAM2 541 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A12Q96S37 553 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCNT4Q9P109 453 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BEST1O76090 585 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD19P15391 556 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAGEA9P43362 315 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFNAR2P48551 515 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTF1Q14872 753 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDGFRLQ15198 375 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HECTD3Q5T447 861 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DUSP16Q9BY84 665 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GMIPQ9P107 970 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MBD3O95983 291 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMPD2Q01433 879 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNK2Q07912 1038 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCF15Q12870 199 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SGO2Q562F6 1265 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPT2Q8TD30 523 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THAP9Q9H5L6 903 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL37Q9NZH6 218 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HESX1Q9UBX0 185 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H0Y858 1186 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC7A9P82251 487 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NHLH1Q02575 133 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP4Q13107 963 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RUNX3Q13761 415 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF77Q15935 545 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM270Q6UE05 265 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPA6Q8N4T0 437 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP2A3Q93084 1043 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EBF3Q9H4W6 596 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms