RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	USP8	P40818	1118 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	APBA1	Q02410	837 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	VIT	Q6UXI7	678 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	UBR7	Q8N806	425 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	E2F7	Q96AV8	911 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	DUSP16	Q9BY84	665 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	BRD9	Q9H8M2	597 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	HESX1	Q9UBX0	185 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	CA14	Q9ULX7	337 aa		18.77	■□□□□ 0.6
USP19-210	ENST00000465902	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	STK25	O00506	426 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF12	O95522	483 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PSMC3	P17980	439 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	RFX1	P22670	979 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	GDI1	P31150	447 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PPP3CC	P48454	512 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KRT31	Q15323	416 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SIX5	Q8N196	739 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	FAM81B	Q96LP2	452 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.76	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZNF263	O14978	683 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CALCA	P01258	141 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PAEP	P09466	180 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	HDC	P19113	662 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TDP1	Q9NUW8	608 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		18.75	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SOBP	A7XYQ1	873 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SMTNL1	A8MU46	457 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZNF165	P49910	485 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PDE6C	P51160	858 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PFKP	Q01813	784 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	UBA3	Q8TBC4	463 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A12	Q96S37	553 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	GMIP	Q9P107	970 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	WNT16	Q9UBV4	365 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.74	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	BECN2	A8MW95	431 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	HHLA1	C9JL84	531 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	WEE1	P30291	646 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	BCAT1	P54687	386 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	IER5L	Q5T953	404 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TTC30A	Q86WT1	665 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	FLCN	Q8NFG4	579 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TFAP2B	Q92481	460 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	IRF7	Q92985	503 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	NACA2	Q9H009	215 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	NCAN	O14594	1321 aa		18.73	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PIEZO1	Q92508	2521 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902		M0QYV0	167 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902		O00370	1275 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	AVPR2	P30518	371 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PDE4C	Q08493	712 aa		18.72	■□□□□ 0.59

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