RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 LCORLQ8N3X6 602 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA5Q8NB90 893 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB10Q8WXI3 467 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 LPIN2Q92539 896 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 COQ10AQ96MF6 247 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GLOD4Q9HC38 313 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KLC4Q9NSK0 619 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 USP22Q9UPT9 525 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PPM1DO15297 605 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 YY2O15391 372 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MPPED1O15442 326 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 NXPH3O95157 252 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HKR1P10072 659 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 UQCRC1P31930 480 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FOLR3P41439 243 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GRK6P43250 576 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GATMP50440 423 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PGDP52209 483 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 POLE2P56282 527 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PTK2BQ14289 1009 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNAB1Q14722 419 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CCT6BQ92526 530 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP10Q96AY3 582 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RMDN3Q96TC7 470 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PPCSQ9HAB8 311 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 EHD3Q9NZN3 535 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 B8ZZF3 427 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMD9O00233 223 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SYT5O00445 386 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CD19P15391 556 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TGM1P22735 817 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ADORA2AP29274 412 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 BMPR2Q13873 1038 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SPARCL1Q14515 664 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PFKFB4Q16877 469 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC174Q6PII3 467 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM71BQ8TC56 605 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXL20Q96IG2 436 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 Q96MF0 132 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MAST3O60307 1309 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2W5A6NFC9 320 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 NPC1O15118 1278 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ORC4O43929 436 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MST1P26927 711 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CHKAP35790 457 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HALP42357 657 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXO1Q12778 655 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GPS1Q13098 491 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CLCA4Q14CN2 919 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TBCCQ15814 346 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GGT6Q6P531 493 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 C18orf8Q96DM3 657 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PBKQ96KB5 322 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MLST8Q9BVC4 326 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS51Q9UID3 782 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 A1L4Q6 167 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC151A5D8V7 595 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZAR1LA6NP61 321 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD11A6QL63 1104 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R3H8 397 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms