RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.34■■□□□ 1.65
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SH3BP5-208ENST00000459627 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-208ENST00000459627 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-208ENST00000459627 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5-208ENST00000459627 MAN2B1O00754 1011 aa25.33■■□□□ 1.65
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SH3BP5-208ENST00000459627 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.33■■□□□ 1.65
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SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.32■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.31■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.31■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 RAD23BP54727 409 aa25.3■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 HHLA1C9JL84 531 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 CUL2Q13617 745 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 R4GN57 208 aa25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 TSSK4Q6SA08 328 aa25.28■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 SP9P0CG40 484 aa25.27■■□□□ 1.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP26A1O43174 497 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMTOR5O43504 91 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 OLFM2O95897 454 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP3CCP48454 512 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC7A9P82251 487 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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