RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 TTPALQ9BTX7 342 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 PAX3P23760 479 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMA2P25787 234 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 PEX5P50542 639 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 TKTL1P51854 596 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 EPC1Q9H2F5 836 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP104O60308 925 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 EFCAB14O75071 495 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 EFEMP2O95967 443 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY1Q08828 1119 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CDO1Q16878 200 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 USP17L7P0C7H9 530 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP11AP98196 1134 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 DDR2Q16832 855 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA18Q8TC71 538 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF558Q96NG5 402 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 VNN2O95498 520 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 PRLRP16471 622 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJB2P25686 324 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC8A3P57103 927 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ABHD8Q96I13 439 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 HSFY1Q96LI6 401 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC00271P0C7V0 271 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PYGMP11217 842 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CPB1P15086 417 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PDGFRAP16234 1089 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 GRIK1P39086 918 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF280DQ6N043 979 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MNS1Q8NEH6 495 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MYOGP15173 224 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 C2orf54Q08AI8 447 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D4O60343 1298 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PGFP49763 221 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 USP41Q3LFD5 358 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC14Q49A88 953 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM169Q96HH4 297 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 E7ENQ6 273 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 IL1R2P27930 398 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 NR2E1Q9Y466 385 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 LRCH4O75427 683 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 OR1D2P34982 312 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms