RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448372.5

SENP1-201, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP1, Length 4,679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-201ENST00000448372 HIST1H2ADP20671 130 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-201ENST00000448372 ELK3P41970 407 aa7.55□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 FLOT2Q14254 428 aa7.55□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 DNAJC18Q9H819 358 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-201ENST00000448372 SETD4Q9NVD3 440 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 SUFUQ9UMX1 484 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 PJA2O43164 708 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 C16orf89Q6UX73 402 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-201ENST00000448372 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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SENP1-201ENST00000448372 TMEM237Q96Q45 408 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-201ENST00000448372 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-201ENST00000448372 AP3B1O00203 1094 aa7.53□□□□□ -1.2
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