RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TTC8Q8TAM2 541 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PROX1Q92786 737 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM167AQ96KS9 214 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf10Q9HB07 376 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA12AO43301 675 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ARIH2O95376 493 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MOCS3O95396 460 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RAP1GAPP47736 663 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PAK1Q13153 545 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF677Q86XU0 584 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TIGD4Q8IY51 512 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EXD1Q8NHP7 514 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TP53INP1Q96A56 240 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NPHS2Q9NP85 383 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NUP155O75694 1391 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM120BA0PK00 339 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 E5RI56 91 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK1O00180 336 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SNX3O60493 162 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PDE8AO60658 829 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PROS1P07225 676 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NT5C2P49902 561 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TKTL1P51854 596 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCB1Q12824 385 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 COASYQ13057 564 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PNOCQ13519 176 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MTF1Q14872 753 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UBE3CQ15386 1083 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PMF1Q6P1K2 205 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KIF18BQ86Y91 864 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CYGBQ8WWM9 190 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 E2F8A0AVK6 867 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD18B2RXH4 712 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A9O60656 530 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM13O60858 407 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP9O95302 570 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PNPP00491 289 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 IL1R1P14778 569 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A6P19224 532 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DRD4P21917 467 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A1P22309 533 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A4P22310 534 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ENPP1P22413 925 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PKLRP30613 574 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A3P35503 534 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A5P35504 534 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HSD17B3P37058 310 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GP5P40197 560 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HTR2BP41595 481 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PGS1Q32NB8 556 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PDPRQ8NCN5 879 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM13CQ8NE31 585 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms