RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435497.1

LINC00028-201, long intergenic non-protein coding RNA 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00028, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00028-201ENST00000435497 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CPQQ9Y646 472 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 A0A087X0B3 334 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 F8VP50 259 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ADAM23O75077 832 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 IDEP14735 1019 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TIE1P35590 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PTGER3P43115 390 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PDE6CP51160 858 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CACNA2D1P54289 1103 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CYP27A1Q02318 531 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MYO1EQ12965 1108 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 DEFB124Q8NES8 71 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PNKPQ96T60 521 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PANK2Q9BZ23 570 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PANK4Q9NVE7 773 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TNFRSF10BO14763 440 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 KAT7O95251 611 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HOXD13P35453 343 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TAF10Q12962 218 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ALCAMQ13740 583 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 C8orf48Q96LL4 319 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF233A6NK53 670 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TRIM66O15016 1216 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ALDH1A2O94788 518 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ABL1P00519 1130 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TNNC2P02585 160 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 APODP05090 189 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ANXA13P27216 316 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PPP3CCP48454 512 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SYT12Q8IV01 421 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HPS3Q969F9 1004 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MMS19Q96T76 1030 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HCN2Q9UL51 889 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 MAP3K13O43283 966 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TACC1O75410 805 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ENGP17813 658 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 GRIA2P42262 883 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 TNFRSF4P43489 277 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 LMAN2Q12907 356 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 RESTQ13127 1097 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SURF1Q15526 300 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 EOGTQ5NDL2 527 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PIP4P1Q86T03 277 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 WHAMMQ8TF30 809 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HMGB4Q8WW32 186 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00028-201ENST00000435497 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms