RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 PLIN5Q00G26 463 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AMER2Q8N7J2 671 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EHD1Q9H4M9 534 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 VPS4AQ9UN37 437 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CLOCKO15516 846 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GNG2P59768 71 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TEX12Q9BXU0 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL31Q9H511 634 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRPSAP2O60256 369 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CD19P15391 556 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 COMTP21964 271 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NCOA4Q13772 614 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TRIQKQ629K1 86 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DGKHQ86XP1 1220 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OXER1Q8TDS5 423 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EBF3Q9H4W6 596 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ING4Q9UNL4 249 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PEX11AO75192 247 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ITIH1P19827 911 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BCAP31P51572 246 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IDI1Q13907 227 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF394Q53GI3 561 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TTI2Q6NXR4 508 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ERO1BQ86YB8 467 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 H7C1W4 665 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A9O60656 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.349e-16■■■■□ 23.2
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A6P19224 532 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A1P22309 533 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A4P22310 534 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A3P35503 534 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A5P35504 534 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AKR1D1P51857 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NLRP4Q96MN2 994 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HEATR9A2RTY3 570 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MYO1DO94832 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 BFSP2Q13515 415 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.68□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 NEDD4P46934 1319 aa6.68□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 VPS39Q96JC1 886 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PAFAH2Q99487 392 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HIPK3Q9H422 1215 aa6.68□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 PDXKO00764 312 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NEMP1O14524 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SPTLC1O15269 473 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BMP10O95393 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 H6PDO95479 791 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CRYZL1O95825 349 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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