RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNCQ9H7C4 482 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RFC5P40937 340 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF276Q8N554 614 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 BANPQ8N9N5 519 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC13Q8NBP0 860 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD6Q8NC69 237 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRN2Q92932 1015 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDCD1Q96RS6 583 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 DHRS4Q9BTZ2 278 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CALB2P22676 271 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM1Q13255 1194 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC6Q86X45 466 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 IGDCC3Q8IVU1 814 aa19.52■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 CALN1Q9BXU9 219 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 BATF3Q9NR55 127 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NRBP2Q9NSY0 501 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KANSL3Q9P2N6 904 aa19.52■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 KRT19P08727 400 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD23BP54727 409 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH8P55286 799 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CPXM1Q96SM3 734 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FETUBQ9UGM5 382 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 EVPLQ92817 2033 aa19.52■□□□□ 0.71
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SH3BP1-202ENST00000417536 ENTPD5O75356 428 aa19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1-202ENST00000417536 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 STK32AQ8WU08 396 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN18Q99952 460 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 XYLT2Q9H1B5 865 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 EFR3BQ9Y2G0 817 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN4AP35499 1836 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RBP3P10745 1247 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAZP19086 355 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN4P29074 926 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP120Q8N960 986 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF149Q8NC42 400 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1-202ENST00000417536 LPXNO60711 386 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MT-ND3P03897 115 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCBP05771 671 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXC6P09630 235 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TPBGLP0DKB5 382 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 EDNRBP24530 442 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ICAM3P32942 547 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ELK3P41970 407 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNG1P51959 295 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 IGBP1P78318 339 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NPNTQ6UXI9 565 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP69A5D8W1 941 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP56O00567 594 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MAFO75444 373 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NEFHP12036 1026 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PTK7Q13308 1070 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA18Q8TC71 538 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 HEY2Q9UBP5 337 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MCF2LO15068 1137 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ERBB2P04626 1255 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ADORA2AP29274 412 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MIPP30301 263 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 EFNA5P52803 228 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 DPYSL3Q14195 570 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM111AQ96PZ2 611 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CYTH2Q99418 400 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MIPEPQ99797 713 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS11Q9H270 941 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MMRN1Q13201 1228 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 XYLT1Q86Y38 959 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC17Q96AE7 1141 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
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