RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391046.1

RNU6-1300P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1300, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1300P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SP2Q02086 613 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FHL3Q13643 280 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LIN54Q6MZP7 749 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GCC1Q96CN9 775 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZAR1LA6NP61 321 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 M0R3H8 397 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AGPSO00116 658 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PPM1DO15297 605 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SNX2O60749 519 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USP1O94782 785 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SPDEFO95238 335 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ITGA2BP08514 1039 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SRGNP10124 158 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PPP3CBP16298 524 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EPHA3P29320 983 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NTSR1P30989 418 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GPS1Q13098 491 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DTX2Q86UW9 622 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PALM2Q8IXS6 379 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CASS4Q9NQ75 786 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 BTBD11A6QL63 1104 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FCHO1O14526 889 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PCDH17O14917 1159 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DNPH1O43598 174 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PPFIA4O75335 1185 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 VIPP01282 170 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ANXA6P08133 673 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PDHA1P08559 390 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PNLIPRP1P54315 467 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GUCY1B3Q02153 619 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 POU5F1BQ06416 359 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SCAPQ12770 1279 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CDSNQ15517 529 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TAF5Q15542 800 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TIGD6Q17RP2 521 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LY6KQ17RY6 165 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RFX8Q6ZV50 586 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GPR149Q86SP6 731 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LPIN2Q92539 896 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RSC1A1Q92681 617 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FZD1Q9UP38 647 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USP22Q9UPT9 525 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 UNC119BA6NIH7 251 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 IRAK2O43187 625 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DHHO43323 396 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PEX11BO96011 259 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ERBB2P04626 1255 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GYS1P13807 737 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms