RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRR34Q9NV39 138 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 OXSMQ9NWU1 459 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 MSRB1Q9NZV6 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 JKAMPQ9P055 326 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 INSL5Q9Y5Q6 135 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 EVPLQ92817 2033 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM129A0AVI4 362 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM171A2A8MVW0 826 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF814B7Z6K7 855 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADCY3O60266 1144 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GAS7O60861 476 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAB11FIP3O75154 756 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC43A1O75387 559 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GLUD1P00367 558 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 MT-CO3P00414 261 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PDHA1P08559 390 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 DAOP14920 347 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCNA6P17658 529 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 DDCP20711 480 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PCSK1P29120 753 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 LSP1P33241 339 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDKN1AP38936 164 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GLUD2P49448 558 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 MANFP55145 182 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 LGALS4P56470 323 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 YPEL5P62699 121 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCNB1Q14721 858 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PLCB4Q15147 1175 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 HLFQ16534 295 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 MUM1L1Q5H9M0 696 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 VPS53Q5VIR6 699 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 RANBP10Q6VN20 620 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC30A10Q6XR72 485 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF497Q6ZNH5 498 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 DCDC5Q6ZRR9 648 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FRMD7Q6ZUT3 714 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 KIF18BQ86Y91 864 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF248Q8NDW4 579 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PSD4Q8NDX1 1056 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC17A8Q8NDX2 589 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GIPC2Q8TF65 315 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM222BQ8WU58 562 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 RUNDC1Q96C34 613 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 R3HDM4Q96D70 268 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SCLYQ96I15 445 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAX2Q96IS3 184 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 HS6ST2Q96MM7 605 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PGLYRP2Q96PD5 576 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATOH8Q96SQ7 321 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PIMREGQ9BSJ6 248 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADI1Q9BV57 179 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 CNPPD1Q9BV87 410 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCTD10Q9H3F6 313 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 TASP1Q9H6P5 420 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 C1orf115Q9H7X2 142 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERHLQ9NQF3 203 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASIC5Q9NY37 505 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FNIP2Q9P278 1114 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEMA5BQ9P283 1151 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GABRQQ9UN88 632 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 DTX4Q9Y2E6 619 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 A1L4Q6 167 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM172BPA6NC97 362 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 C2CD4BA6NLJ0 364 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 CBX4O00257 560 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 WNT10BO00744 389 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 GRM6O15303 877 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASAP2O43150 1006 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 KDM1AO60341 852 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASLP04424 464 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FPR3P25089 353 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 PPIFP30405 207 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 IARSP41252 1262 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 CTXN1P60606 82 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 OCRLQ01968 901 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 ST3GAL1Q11201 340 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEMA5AQ13591 1074 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 DLGAP5Q15398 846 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEC23BQ15437 767 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM110CQ1W6H9 321 aa0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms