RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 INTS13Q9NVM9 706 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM248Q9NWD8 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ING3Q9NXR8 418 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ANAPC11Q9NYG5 84 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 UBP1Q9NZI7 540 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 KCMF1Q9P0J7 381 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SH3BP4Q9P0V3 963 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 POGKQ9P215 609 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 IGSF9Q9P2J2 1179 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 HSFX1Q9UBD0 423 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 USP25Q9UHP3 1055 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAI1Q9UI46 699 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DCTN4Q9UJW0 460 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 HDAC5Q9UQL6 1122 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC12A7Q9Y666 1083 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 AK5Q9Y6K8 562 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DMDP11532 3685 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FLT4P35916 1363 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 USP31Q70CQ4 1352 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 MYO7AQ13402 2215 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A0A6YYJ9 748 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A1W2PQH9 124 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PLSCR5A0PG75 271 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 DENND3A2RUS2 1198 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM8BA6NDV4 472 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 MINDY4BA8MYZ0 360 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 EPM2AB3EWF7 344 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TCP11X1B4DZS4 312 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FZD9O00144 591 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NOP56O00567 594 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 MSI1O43347 362 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 BUB3O43684 328 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PRAMEF10O60809 474 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 OPHN1O60890 802 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXH1O75593 365 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FSBPO95073 299 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NXPH3O95157 252 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 CSPG5O95196 566 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 GJB6O95452 261 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 LY86O95711 162 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 KRT6AP02538 564 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 A1BGP04217 495 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 KRT6BP04259 564 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 P4HBP07237 508 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 RHOP08100 348 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 F7P08709 466 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 CTSAP10619 480 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NAT2P11245 290 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP3CBP16298 524 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 RXRAP19793 462 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 SP100P23497 879 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 GATA3P23771 443 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ZBTB25P24278 435 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 CDC25CP30307 473 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 MCM4P33991 863 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 ECI1P42126 302 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 KRT6CP48668 564 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 POLD2P49005 469 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FNTBP49356 437 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 FLT3LGP49771 235 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NDUFV1P49821 464 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD49B-201ENST00000365172 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms