RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TTC16Q8NEE8 873 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA20Q8TB22 786 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 RIN3Q8TB24 985 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TSG101Q99816 390 aa8.14□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 MED10Q9BTT4 135 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CHRDQ9H2X0 955 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 EBF3Q9H4W6 596 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.116e-6■■■□□ 15
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SGMS1-201ENST00000361543 KRT82Q9NSB4 513 aa8.14□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 R4GN57 208 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 AP1G2O75843 785 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC130P13994 396 aa8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 PDGFRLQ15198 375 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 KRT39Q6A163 491 aa8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 NUP93Q8N1F7 819 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 IER2Q9BTL4 223 aa8.13□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 GCNT4Q9P109 453 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 EML5Q05BV3 1969 aa8.13□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA7O14818 248 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ABL1P00519 1130 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNB1P11230 501 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ARSAP15289 507 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TCF3P15923 654 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PFKLP17858 780 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 HDCP19113 662 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 YWHAQP27348 245 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP3CCP48454 512 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 IFNAR2P48551 515 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A3P53794 718 aa8.12□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 FOXK2Q01167 660 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TAF10Q12962 218 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CCINQ13939 588 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R5DQ14738 602 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 WDR44Q5JSH3 913 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TSSK4Q6SA08 328 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZS52 159 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ADSSL1Q8N142 457 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CPA6Q8N4T0 437 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf29Q8N999 325 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.12□□□□□ -1.11
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