RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 THTPAQ9BU02 230 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 YY1AP1Q9H869 796 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 SUFUQ9UMX1 484 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 CAND2O75155 1236 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 C16orf89Q6UX73 402 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 C5orf58C9J3I9 102 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.83■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.83■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 RARRES1P49788 294 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 KAT2BQ92831 832 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 APOL2Q9BQE5 337 aa21.82■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.82■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 KLHL2O95198 593 aa21.82■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 PJA2O43164 708 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 FLOT2Q14254 428 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 C16orf87Q6PH81 154 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 TEX9Q8N6V9 391 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 TKTL1P51854 596 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 FAM136AQ96C01 138 aa21.81■■□□□ 1.08
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