RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 ROR1Q01973 937 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 SMARCB1Q12824 385 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM7Q9C029 511 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 ZBP1Q9H171 429 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 CERS4Q9HA82 394 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 PATJQ8NI35 1801 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
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HOXA4-201ENST00000360046 MESDQ14696 234 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 TMC7Q7Z402 723 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 ABCB6Q9NP58 842 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA4-201ENST00000360046 WDR27A2RRH5 827 aa23.01■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 RB1P06400 928 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 TKTL1P51854 596 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 PTPROQ16827 1216 aa23.01■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 VSTM1Q6UX27 236 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.01■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.01■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 ENC1O14682 589 aa23■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 FANCGO15287 622 aa23■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 LAMA3Q16787 3333 aa23■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 RAB41Q5JT25 222 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 PEX26Q7Z412 305 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 EMC1Q8N766 993 aa22.98■■□□□ 1.27
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HOXA4-201ENST00000360046 NCK2O43639 380 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO21O94952 628 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJB1P25685 340 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 UBE3AQ05086 875 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-201ENST00000360046 TAF5Q15542 800 aa22.97■■□□□ 1.27
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