RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353278.8

SLC6A20-201, Transcript of solute carrier family 6 member 20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A20, Length 5,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20-201ENST00000353278 TBX4P57082 545 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CREMQ03060 361 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CTNNB1P35222 781 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CASP4P49662 377 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NCKAP1LP55160 1127 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 OTULINQ96BN8 352 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 DNAJC7Q99615 494 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 RAB23Q9ULC3 237 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 TGM2P21980 687 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SERPINB4P48594 390 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SGO1Q5FBB7 561 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CCNJLQ8IV13 435 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 HOMEZQ8IX15 550 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 RFWD2Q8NHY2 731 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PNKPQ96T60 521 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NWD1Q149M9 1564 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PGK1P00558 417 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ERVK-10P10266 1014 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 DMTNQ08495 405 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PTK7Q13308 1070 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SERPINB11Q96P15 392 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FBXO10Q9UK96 956 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.64□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 RAP1GAPP47736 663 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NCALDP61601 193 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 STX19Q8N4C7 294 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 INTS13Q9NVM9 706 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FZD1Q9UP38 647 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SLIT1O75093 1534 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CYP11B1P15538 503 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 LRRC14Q15048 493 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SV2AQ7L0J3 742 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SOAT1P35610 550 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GPR142Q7Z601 462 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 JAMLQ86YT9 394 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 WDR18Q9BV38 432 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 KRT87PA6NCN2 255 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GLTPD2A6NH11 291 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SPTLC1O15269 473 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NCAM2O15394 837 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 RAMP2O60895 175 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 SGPL1O95470 568 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 AGTP01019 485 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PON1P27169 355 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PTPN7P35236 360 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GGCXP38435 758 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 DACH2Q96NX9 599 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GAD1Q99259 594 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NAT9Q9BTE0 207 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 CCL23P55773 120 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 MAP3K10Q02779 954 aa11.63□□□□□ -0.55
SLC6A20-201ENST00000353278 GRIN1Q05586 938 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms