RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 MIPP30301 263 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 WLSQ5T9L3 541 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V1C1P21283 382 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 STILQ15468 1287 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 VWA5AO00534 786 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 CXCL8P10145 99 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF398Q8TD17 642 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 BSNDQ8WZ55 320 aa16.11■□□□□ 0.17
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